La despenalización del aborto y los matrimonios entre personas del mismo sexo son argumentos que usa la Diócesis de Guanajuato para llamar abiertamente a la feligresía a no votar por Morena el dos de junio, esperando a ser secundada por 71 diócesis más, sin embargo, el descontento de la Iglesia católica hacia la 4T ha estado presente a lo largo del sexenio por su acercamiento con las iglesias evangélicas, por su estrategia de combate al crimen organizado, en cuyos territorios, obispos han tenido que negociar acuerdos de paz, además del asesinato de dos sacerdotes jesuitas